较为常见的伦理问题有：在代孕交易情况下，部分女性沦为“子宫出售者”，显然形成对女性的人格尊严的侮辱；委托代孕生产后，因代孕子女的性别或者疾病等原因，代孕母亲与基因母亲都不愿意抚养代孕子女，甚至基因母亲会选择代孕子女的性别，强迫代孕母亲流产；在代孕交易过程中，孩子是商品吗；在亲子关系纠纷中，对代孕子女的影响等。