光绪皇帝在阅读了这份保荐奏折之后命令：“电寄荣禄，著传知袁世凯即行来京陛见。”并且他下令按程序将徐致靖的这份保荐书“恭呈慈览”。
9月16日黎明时分，光绪皇帝在颐和园毓兰堂召见袁世凯，垂询军事方面的问题甚详。袁世凯均据实回答。当天的召见本身没有多少内容，君臣之间的对话也没有什么出彩的地方，原本对此次召见甚有期待的袁世凯颇感失望，他在退下之后即奏曰：“九月有巡幸大典，督臣荣禄饬臣督率修理操场，并先期商演阵图，亟须回津料理。倘无垂询事件，即请训。”光绪皇帝就此传下话来，嘱袁世凯待四日后请训，不会耽搁天津方面的事务等。随后，光绪皇帝任命袁世凯为侍郎候补，专责训练新式军队。
第二天一大早，袁世凯来到颐和园谢恩，当面向光绪皇帝表示自己无寸尺之功，受破格之赏，惭怵万状。光绪皇帝笑着说：“人人都说你练的兵、办的学堂甚好，此后可与荣禄各办各事。”
9月18日晚，袁世凯因接到回防天津小站的命令，正在准备请求提前请训的奏折时，谭嗣同在夜幕沉沉中匆匆前来拜访。谭嗣同首先对袁世凯的提升表示祝贺，紧接着就告诉袁有密语相告。袁世凯告诉谭嗣同，因为刚刚收到天津方面的电报，得知英国兵舰数艘在大沽口海面游弋，正在准备具折次日请训，请训后即回天津。听了袁世凯的说明，谭嗣同引入正题道：“外侮不足忧，大可忧者，内患耳。”世凯急询其故，嗣同乃云：“公受此破格特恩，必将有以图报，上方有大难，非公莫能救。”