另外，假设中不能有自相矛盾的地方。比如一边假设小偷拆下了通风口处的档板，从通风口钻入房间，一边假设小偷是一个身材魁梧的人，这样的假设就是自相矛盾的。通风口很狭窄，如果一个人能从通风口钻进去，说明这个人一定长得很瘦小，如果是一个魁梧的人，刚一进入就会被卡住，更不要说进入房间，这种自相矛盾的假设在一开始就要被杜绝。
科学的假设推理对案件的侦破有着重要意义。当一起案件缺失了一些重要线索或重要构成时，运用科学的假设推理能够将破碎的案件重新拼完整，形成一个完整的案件，发现遗漏的环节。
在一起离奇的少女失踪案中，失踪的少女是一户有钱人家的小姐，因为身体柔弱，所以平日很少出门。每天早上和傍晚她都会带着她的泰迪犬到院子里散步。少女的父母很少在家，平时只有她和一名保姆住在小别墅里，别墅的大门外有监控，少女失踪当天的监控录像显示，曾有一名戴着帽子，抱着一个大箱子的男子来过别墅，保姆也证明，当天确实来过这样一名男子，小姐说箱子里是她为泰迪犬新买的狗舍，所以让送货的人直接送进了屋里。送货员送完东西后便离开了，快到傍晚时，保姆发现小姐还是没有出现，便上楼叫她，却发现小姐已经不在房间里了。