事情还没完。严嵩不甘心落败，他在老家还给嘉靖写信，制造祥瑞之兆，希望嘉靖回心转意。但嘉靖已经听说，严世蕃并未到充军戍地报到，而是在中途折回江西。1564年年底，御史举报，严世蕃招募了4000多人图谋不轨。这次举报，真实性已经不重要了，重要的是，有人想要对严嵩斩草除根。
严世蕃被押到北京下狱。审讯过程中，徐阶亲自指点会审人员应该怎么做罪名，才能置严世蕃于死地。在徐阶的过问下，严世蕃的罪名从坑害言官，变成了勾结倭寇图谋叛逆。严世蕃在狱中听到徐阶修改案卷的消息，哀叹说，这下彻底完蛋了。
1565年，严世蕃被斩首。严嵩和他的孙子们被贬为平民，严家被抄家。两年后，无家可归的严嵩，在饥寒交迫中死了。
徐阶则成为嘉靖朝的最后一任内阁首辅。但经过这么多年的权斗纷争，他的心境，其实是悲凉的。
