有了这两个过硬的国外关系，但是却没有和蒋介石过硬的关系，所以在国民党中，孙立人实际上属于被打压的一类人。
国民党败退台湾后，出于巴结英美的考虑，蒋介石才把孙立人提为陆军总司令。蒋介石虽然提拔了孙立人，但并不信任他。不仅如此，在军队中，孙立人和蒋经国的矛盾也开始加剧。
孙立人受的是西方军事教育，他对蒋经国在军队中搞“特务”那一套很反感，从而激化了与“太子”的矛盾。1954年时，孙立人被撤销陆军总司令，改任 “总统府参军长” 这个闲职。
在1955年6月的阅兵前夕，蒋经国的情报机构得到“消息”（据说这个消息系蒋经国等人捏造），孙立人的势力将在阅兵时，把炮口朝向蒋介石轰击。
得知这个消息后，蒋介石父子立即采取行动，把孙立人软禁了起来。孙立人被软禁了，和孙立人有关系的人也难逃厄运。
因缘巧合，俞济时因为昨晚枪支走火，而没有跟随在蒋介石身边，俞济时歉意非常大。蒋经国和很多警卫都认为，俞济时昨天的受伤实际上是“苦肉计”，目的是为了逃避阅兵时和蒋介石站在一起。